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HDAC

Histone deacetylases，组蛋白去乙酰化酶

 

HDAC (histonedeacetylases)，中文全称叫做组蛋白脱乙酰酶，是组蛋白修饰过程中一类重要的酶，催化并调控组蛋白去乙酰化。

 

目前在人体中已经发现 18 种 HDAC，分别属于四种类别（I、II、III 和 IV）。其中Ⅰ、Ⅱ 和 Ⅳ 类等 11 个亚型均为 Zn2+ 依赖型的蛋白；Ⅲ 类亚族的 7 个亚型 Sir 1～7 以 NAD+ 为催化活性位点。

Ⅰ类 HDAC 包括HDAC1、2、3和8，其与酵母 RPD3 蛋白同源，分布在细胞核内，主要发挥抑制基因转录的功能。

Ⅱ类 HDAC (HDAC4、5、6、7、9和10) 与酵母Hda1蛋白具有同源性，分布在细胞质，同时在细胞核与细胞质之间穿梭。

Ⅲ类HDAC 是 NAD+ 依赖性蛋白脱乙酰酶，与ADP核糖基化转移酶共同参与调节多种细胞过程，如存活、衰老、应激反应和新陈代谢

唯一的 Ⅳ 类 HDAC 是 HDAC11，其与Ⅰ类和Ⅱ类酶的催化核心区域具有序列同源性，但是不具有足够的相似性。

 

HDAC抑制剂是潜在的抑制增殖的化合物，它可以诱导细胞凋亡。因此这些药物可作为潜在的抗肿瘤药物，也可以作为HDAC功能分析的工具药。第Ⅰ、Ⅱ和Ⅳ类属于Zn2+依赖的或经典的组蛋白去乙酰化酶类；而第Ⅲ类属于NAD+依赖的组蛋白去乙酰化酶类。第Ⅰ类介导了细胞内大多数去乙酰化活性，第Ⅱ类可能参与神经元的核转运，第Ⅲ类与代谢和寿命调控相关，而第Ⅳ的的功能的研究甚少。其中Ⅰ、Ⅱ和Ⅳ均有特异性抑制剂。尽管对Ⅲ类HDAC抑制剂有很强的兴趣，HDAC抑制剂作为抗肿瘤药物主要靶向Ⅰ、Ⅱ和Ⅳ类酶为主。

 

伏立诺他（vorinostat）、罗米地辛（romidepsin）、贝利司他（belinostat）、帕比司他（panobinostat）等为美国 FDA 批准上市，用于临床治疗外周T细胞淋巴瘤、皮肤 T 细胞淋巴瘤和多发性骨髓瘤；西达本胺（tucidinostat/chidamide）由我国 NMPA 批准上市，用于外周T细胞淋巴瘤和乳腺癌。其中，除西达本胺为 HDAC I 类及 HDAC 10 亚型选择性抑制剂外，其它四个均为 HDAC 泛抑制剂；它们在抑制HDACI类和IIb类的同时，对 HDACⅡa或 HDAC IV类，如 HDAC5、HDAC9、HDAC11 亚型等也有抑制活性，且对 HDACⅡa 和 Ⅳ 类酶的抑制存在更多潜在毒副作用。

HDAC 相关靶点
货号 产品名 中文名称 产品描述
SJ-MX0286A Givinostat

Givinostat (ITF-2357) 是 HDAC 抑制剂。抑制 HDAC1 和 HDAC3，IC50 分别为 198 nM 和 157 nM。
SJ-MN0055B Valproic acid sodium (2:1) 丙戊酸半钠

Valproic acid (VPA) sodium (2:1) 是一种具有口服活性的 HDAC 抑制剂，IC50 值为 0.5-2 mM，抑制 HDAC1 的活性 (IC50=400 μM)，同时可诱导 HDAC2 的降解。Valproic acid sodium (2:1) 激活 Notch1 信号并抑制小细胞肺癌 (SCLC) 细胞的增殖。Valproic acid sodium (2:1) 可用于癫痫、双相情感障碍、代谢疾病、HIV 感染和偏头痛等的研究。
SJ-MX4483 HPOB HPOB是高效的组蛋白去乙酰化酶6(HDAC6)选择性抑制剂,IC50值为56 nM,对于其他HDAC的有效性要弱30多倍。
SJ-MX4538 SKLB-23bb SKLB-23bb 是一种新型的，有效的，口服生物可用的选择性组蛋白去乙酰化酶6 (HDAC6)抑制剂，具有抗癌，抗有丝分裂/抗微管蛋白和神经保护作用。SKLB-23bb抑制 HDAC的IC50 为 17 nM，比抑制 HDAC1 (IC50= 422 nM) 和 HDAC8 (IC50=3398 nM) 选择性分别高 25 倍和 200 倍。
SJ-MX4575 HDAC-IN-3 HDAC-IN-3是组蛋白脱乙酰酶（HDAC）抑制剂。
SJ-MX4815 ACY-775

ACY-775 是一个有效的，选择性强的组蛋白脱乙酰酶 6 (HDAC6) 抑制剂 IC50 值为 7.5 nM。ACY775 还抑制 MBLAC2。
SJ-MX4826 HDAC8-IN-1

HDAC8-IN-1 是组蛋白去乙酰化酶8 (HDAC8;IC50 = 27.2 n）。HDAC8-IN-1对HDAC8的选择性超过对HDAC1-3、-4、-6、-10和-11的选择性（IC50均 ≥ 3000 nM）。HDAC8-IN-1 对A549、H1299和CL1-5肺癌细胞具有细胞毒性，IC50 分别为7.9、7.2和7 μM。
SJ-MX5228 1-Naphthohydroxamic acid 1-Naphthohydroxamic acid (Compound 2) 是一种有效的，选择性的 HDAC8 抑制剂，IC50 为 14 μM。1-Naphthohydroxamic acid 对 HDAC8 的选择性高于 I 类 HDAC1 和 II 类 HDAC6 (IC50 >100 μM)。1-Naphthohydroxamic acid 不会增加整体组蛋白 H4 的乙酰化，也不会降低总细胞内 HDAC 的活性。1-Naphthohydroxamic acid 可诱导微管蛋白乙酰化。
SJ-MX5254 Suberoyl bis-hydroxamic acid Suberoyl bis-hydroxamic acid (Suberohydroxamic acid; SBHA) 是竞争性且可透过细胞的 HDAC1 和 HDAC3 抑制剂，ID50 值分别为 0.25 μM 和 0.30 μM。Suberoyl bis-hydroxamic acid 使肿瘤细胞易于凋亡 (apoptosis) 并促进线粒体凋亡途径。Suberoyl bis-hydroxamic acid 可用于甲状腺髓样癌 (MTC) 的研究。
SJ-MX5359 Splitomicin Splitomicin (Splitomycin) 是一种选择性的 Sir2p 抑制剂。Splitomicin 抑制 Sir2 蛋白的 NAD+ 依赖性 HDAC 活性。Splitomicin 抑制酵母提取物中 HDAC，IC50 为 60 μM。
SJ-MX5386 5-Phenylpentan-2-one 苯丁酸；苯基丁酸 Phenylbutyrate 是一种有效的组蛋白去乙酰化酶 (HDACs) 抑制剂。Phenylbutyrate 可用于尿素循环障碍研究。
SJ-MX5482 MPI_5a MPI_5a 是一种高效、选择性的 HDAC6 抑制剂 (IC50=36 nM)。MPI_5a 对其他 HDAC 酶的抑制作用很弱。MPI_5a 抑制细胞内酰基微管蛋白的积累的 IC50 值为 210 nM。
SJ-MX8096 J22352

J22352 是一种具有类似靶向嵌合体蛋白水解 (PROTAC) 特性、高度选择性 HDAC6 抑制剂，其 IC50 值为 4.7 nM，J22352 通过抑制胶质母细胞瘤自噬、诱发抗肿瘤免疫反应来促进 HDAC6 降解和诱导抗癌效果，并通过降低 PD-L1 的免疫抑制活性，使宿主抗肿瘤活性恢复。
SJ-MN2123 Bakkenolide A 蜂斗菜内酯 Bakkenolide A 是从 Petasites tricholobus 中提取的天然产物。Bakkenolide A 能通过调节 HDAC3 和 PI3K/ akt 相关信号通路抑制白血病。
SJ-MX6015 KA2507

KA2507 是一种强效的、口服活性和选择性的脱乙酰化酶 6 (histone deacetylase 6, HDAC6 )抑制剂，IC50 为2.5 nM。KA2507 在临床前模型中表现出抗肿瘤活性和免疫调节作用。
SJ-MX6354 KT-531 KT-531 (KT531)是一种有效的选择性HDAC6抑制剂，IC50为8.5 nM，选择性是其他HDAC同工型的 39 倍。
SJ-MN4818 Psammaplin A Psammaplin A 是一种海洋代谢产物，是 HDAC 和 DNA 甲基转移酶 (DNA methyltransferases) 的有效抑制剂。Psammaplin A 是一种高效的选择性 HDAC1 抑制剂，IC50 为 0.9 nM，对 HDAC1 的选择性是 DAC6 的 360 倍，对 HDAC7 和 HDAC8 的效力低 1000 倍以上。Psammaplin A 对革兰氏阳性细菌 (Gram-positive bacteria) 具有抗菌作用，并抑制 DNA 合成和 DNA 促旋酶 (DNA gyrase) 活性。抗肿瘤活性。
SJ-MX7176 BRD-6929 BRD-6929 是 I 类组蛋白去乙酰化酶 HDAC1 和 HDAC2 的脑渗透性选择性抑制剂 (IC50= 1 和 8 nM)。BRD-6929 对 HDAC1 和 HDAC2 有高亲和力 (Ki = 0.2 和 1.5 nM)。BRD-6929 可用于情绪相关行为的研究。
SJ-MX7205 ACY-1083 ACY-1083 是一种可渗透脑的选择性 HDAC6 抑制剂，IC50 为 3 nM，ACY-1083 对 HDAC6 的选择性比其他类别的 HDAC 亚型高 260 倍。ACY-1083 可有效逆转化疗引起的周围神经病变。
SJ-MX7235 FT895 FT895 是一种有效的选择性 HDAC11 抑制剂，IC50 为 3 nM。
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