操作指南 (以下是 SparkJade 的推荐方案。本方案仅提供指导原则,请根据您的具体实验进行修改)
蛋白质交联方案
1. 实验材料:
1.1 无水 DMSO 或 DMF,用于溶解 DSS Crosslinker
1.2 反应缓冲液:使用 pH 为 7 ~ 9 的非胺类缓冲液,如 100 mM 磷酸钠,0.15M NaCl;20 mM HEPES;100 mM 碳酸盐/碳酸氢盐;或 50mM 硼酸盐。
1.3 淬火缓冲液:1M Tris•HCl, pH7.5 (可加入1M甘氨酸或赖氨酸) 通过透析或凝胶去除未反应的试剂。
2. 操作步骤:
2.1 在反应缓冲液中制备蛋白质溶液。
2.2 使用前准备交联剂。将 DSS Crosslinker 溶于 DMSO 或 DMF 中。称量 2 mg Disuccinimidyl Suberate 交联剂于微量离心管中,加入 216 μL 溶剂,使成终浓度为 25 mM。
2.3 在蛋白质样品中加入交联剂。如果蛋白质浓度大于 5 mg/mL,使用 10 倍摩尔过量的交联剂。对于样品浓度小于 5 mg/mL,使用 20- 50 倍摩尔过量的交联剂。建议使用终浓度为 0.25-5 mM 的交联剂。
2.4 将反应混合物在室温下孵育 30 分钟或在冰上孵育 2 小时。
2.5 加入淬灭缓冲液淬灭反应,终浓度为 20~50 mM Tris,或通过透析/脱盐除去未反应的试剂。
2.6 将淬火反应在室温下孵育 15 分钟。
细胞内和细胞外交联反应
交联反应可以在悬浮细胞或培养板上的贴壁细胞上进行。在培养板上时,交联反应主要发生在暴露的细胞表面。因此,交联前,必须充分冲洗细胞表面以去除培养基,否则含胺成分会使反应猝灭。使用浓度高的细胞悬浮液交联效率较高,因为反应中只需添加较少的交联试剂。一般情况下,1-5 mM 的终浓度的交联试剂是有效的。随着 pH 值的增加,NHS 反应速度加快。因此,下面的例子中 pH 为8.0,以便快速完成反应。
1. 所需材料:
1.1 交联剂溶液:在使用前,将 DSS Crosslinker 溶解在干燥的 DMSO 中,使成 10-25 mM。
1.2 磷酸盐缓冲盐水 (PBS): 20 mM 磷酸钠,0.15 M NaCl,pH 值为 8。或使用 pH 7~9 的 HEPES,碳酸氢盐/碳酸盐/硼酸盐缓冲液替代。
1.3 猝灭溶液:1M Tris, pH 7.5 (Tris或甘氨酸将猝灭反应)。
2. 操作步骤:
2.1 将细胞悬浮在 PBS (pH 8.0) 中,约为 25×10-6 细胞/mL。
2.2 用冰冷的 PBS (pH 8.0) 洗涤细胞三次,去除含胺的培养基和蛋白质。对于细胞表面相互作用的研究,在细胞中加入配体,在 4℃ 下孵育 1 小时。
2.3 加入 DSS Crosslinker 溶液至终浓度为 1-5 mM。
2.4 将反应混合物在室温下孵育 30 分钟。
2.5 加入猝灭溶液至终浓度为 10-20 mM Tris,淬灭反应。
2.6 淬灭反应在室温下进行 15 分钟。
【注意】:
1. DSS Crosslinker 对湿度敏感。为了避免湿气凝结到产品上,在打开前必须将小瓶平衡到室温。
2. NHS -酯部分易水解,因此不要制备储存液,实验前现配现用。
3. 交联具有生物活性的蛋白质 (如酶、抗体等) 在偶联时可能导致活性损失,这可能是由分子构象变化引起的。当交联剂修饰结合底物或抗原中涉及的赖氨酸基团时,也可能发生活性损失。调整试剂与目标物的摩尔比可以改善活性损失。或者使用靶向不同官能团的交联剂。
4. NHS 酯的水解是一个竞争性反应,随着ph值的增加而加快。在稀释的蛋白质或肽溶液中更容易发生水解。在浓蛋白溶液中,酰化反应更容易发生。