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HDAC

Histone deacetylases,组蛋白去乙酰化酶

 

HDAC (histonedeacetylases),中文全称叫做组蛋白脱乙酰酶,是组蛋白修饰过程中一类重要的酶,催化并调控组蛋白去乙酰化。

 

目前在人体中已经发现 18 种 HDAC,分别属于四种类别(I、II、III 和 IV)。其中Ⅰ、Ⅱ 和 Ⅳ 类等 11 个亚型均为 Zn2+ 依赖型的蛋白;Ⅲ 类亚族的 7 个亚型 Sir 1~7 以 NAD+ 为催化活性位点。

Ⅰ类 HDAC 包括HDAC1、2、3和8,其与酵母 RPD3 蛋白同源,分布在细胞核内,主要发挥抑制基因转录的功能。

Ⅱ类 HDAC (HDAC4、5、6、7、9和10) 与酵母Hda1蛋白具有同源性,分布在细胞质,同时在细胞核与细胞质之间穿梭。

Ⅲ类HDAC 是 NAD+ 依赖性蛋白脱乙酰酶,与ADP核糖基化转移酶共同参与调节多种细胞过程,如存活、衰老、应激反应和新陈代谢

唯一的 Ⅳ 类 HDAC 是 HDAC11,其与Ⅰ类和Ⅱ类酶的催化核心区域具有序列同源性,但是不具有足够的相似性。

 

HDAC抑制剂是潜在的抑制增殖的化合物,它可以诱导细胞凋亡。因此这些药物可作为潜在的抗肿瘤药物,也可以作为HDAC功能分析的工具药。第Ⅰ、Ⅱ和Ⅳ类属于Zn2+依赖的或经典的组蛋白去乙酰化酶类;而第Ⅲ类属于NAD+依赖的组蛋白去乙酰化酶类。第Ⅰ类介导了细胞内大多数去乙酰化活性,第Ⅱ类可能参与神经元的核转运,第Ⅲ类与代谢和寿命调控相关,而第Ⅳ的的功能的研究甚少。其中Ⅰ、Ⅱ和Ⅳ均有特异性抑制剂。尽管对Ⅲ类HDAC抑制剂有很强的兴趣,HDAC抑制剂作为抗肿瘤药物主要靶向Ⅰ、Ⅱ和Ⅳ类酶为主。

 

伏立诺他(vorinostat)、罗米地辛(romidepsin)、贝利司他(belinostat)、帕比司他(panobinostat)等为美国 FDA 批准上市,用于临床治疗外周T细胞淋巴瘤、皮肤 T 细胞淋巴瘤和多发性骨髓瘤;西达本胺(tucidinostat/chidamide)由我国 NMPA 批准上市,用于外周T细胞淋巴瘤和乳腺癌。其中,除西达本胺为 HDAC I 类及 HDAC 10 亚型选择性抑制剂外,其它四个均为 HDAC 泛抑制剂;它们在抑制HDACI类和IIb类的同时,对 HDACⅡa或 HDAC IV类,如 HDAC5、HDAC9、HDAC11 亚型等也有抑制活性,且对 HDACⅡa 和 Ⅳ 类酶的抑制存在更多潜在毒副作用。

HDAC 相关靶点
货号 产品名 中文名称 产品描述
SJ-MX2971 Nexturastat A Nexturastat A 是一种有效的选择性 HDAC6 抑制剂。Nexturastat A 对 HDAC6 具有抑制作用,IC50 为 5 nM,其选择性高于其他的HDAC至少190倍。Nexturastat A 可用于多发性骨髓瘤 (MM) 的研究。
SJ-MX0305 LMK-235

LMK-235 是一种有效的,选择性的 HDAC4/5 抑制剂,可抑制 HDAC5,HDAC4,HDAC6,HDAC1,HDAC2,HDAC11 和 HDAC8 的活性,IC50 值分别为 4.22 nM,11.9 nM,55.7 nM,320 nM,881 nM,852 nM 和 1278 nM。LMK-235 可用于癌症研究。

SJ-MX3647 Droxinostat Droxinostat (NS 41080)是一种选择性的HDAC抑制剂,最有效作用于HDAC6和8,IC50为2.47 μM和1.46 μM,比作用于HDAC3(IC50=16.9 μM) 选择性高8倍,对HDAC1, 2, 4, 5, 7, 9,和10没有抑制作用。Droxinostat 可用于肝细胞癌 (HCC) 的研究。
SJ-MX3683 EDO-S101 EDO-S101 (Tinostamustine) 是 HDAC 的广谱抑制剂;抑制 HDAC1,HDAC2 和 HDAC3 的 IC50 值分别为 6 nM,9 nM,9 nM 和 25 nM。
SJ-MX6015 KA2507

KA2507 是一种强效的、口服活性和选择性的脱乙酰化酶 6 (histone deacetylase 6, HDAC6 )抑制剂,IC50 为2.5 nM。KA2507 在临床前模型中表现出抗肿瘤活性和免疫调节作用。

SJ-MX3321 Theophylline 茶碱

Theophylline (1,3-Dimethylxanthine) 是有效的磷酸二酯酶 (PDE) 抑制剂,腺苷受体拮抗剂,和组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 活化剂。Theophylline (1,3-Dimethylxanthine) 抑制 PDE3 活性,放松气道平滑肌。Theophylline (1,3-Dimethylxanthine) 通过增加 IL-10 和抑制 NF-κ B进入细胞核而具有抗炎活性。Theophylline (1,3-Dimethylxanthine) 诱发细胞凋亡 (apoptosis)。Theophylline (1,3-Dimethylxanthine) 可用于哮喘和慢性阻塞性肺疾病 (COPD) 的研究。

SJ-MX3458 UF010 UF010是一种有效的选择性I类HADC抑制剂,对HDAC1、HDAC2、HDAC3、HDAC8、HDAC6和HDAC10的IC50值分别为0.5 nM、0.1 nM、0.06 nM、1.5 nM、9.1 nM和15.3 nM。比作用于其他HDACs选择性高6倍多。
SJ-MX3698 CXD101 CXD101 是一种有效的、选择性的、口服活性的 I 类组蛋白脱乙酰酶(histone deacetylase, HDAC)抑制剂,对 HDAC1,HDAC2 和 HDAC3 的 IC50 分别为 63 nM,570 nM 和 550 nM。CXD101 对 II 类 HDAC 没有活性,并具有抗肿瘤活性。
SJ-MX3920 Remetinostat Remetinostat (SHP-141) 是一种基于羟肟酸的组蛋白去乙酰化酶 (HDAC) 的抑制剂,目前正在开发应用于研究皮肤 T 细胞淋巴瘤。
SJ-MX4196 JAK/HDAC-IN-1 JAK/HDAC-IN-1 是一种有效的 JAK2/HDAC 双重抑制剂,在一些血液学细胞系中具有抗增殖和促凋亡作用。JAK/HDAC-IN-1 对 JAK2 和 HDAC 的 IC50 值分别为 4 和 2 nM。
SJ-MX4232 CG347B CG347B 是一种选择性的 HDAC6 抑制剂,也参与合成其他金属酶抑制剂的合成。HDAC6 抑制剂可用于肿瘤学、免疫学和神经学的研究。
SJ-MX4483 HPOB HPOB是高效的组蛋白去乙酰化酶6(HDAC6)选择性抑制剂,IC50值为56 nM,对于其他HDAC的有效性要弱30多倍。
SJ-MX4538 SKLB-23bb SKLB-23bb 是一种新型的,有效的,口服生物可用的选择性组蛋白去乙酰化酶6 (HDAC6)抑制剂,具有抗癌,抗有丝分裂/抗微管蛋白和神经保护作用。SKLB-23bb抑制 HDAC的IC50 为 17 nM,比抑制 HDAC1 (IC50= 422 nM) 和 HDAC8 (IC50=3398 nM) 选择性分别高 25 倍和 200 倍。
SJ-MX4575 HDAC-IN-3 HDAC-IN-3是组蛋白脱乙酰酶(HDAC)抑制剂。
SJ-MX1172 BRD73954 BRD73954 是一种有效的选择性HDAC抑制剂,作用于HDAC6和HDAC8, IC50分别为36 nM和120 nM。
SJ-MX1204 BG45

BG45是一个HDAC I型抑制剂,选择性抑制HDAC3 (IC50=289 nM)。 BG45抑制HDAC1/2/ 6,效力大大降低 (IC50分别为2, 2.2,和>20 μM)。BG45 选择性靶向多发性骨髓瘤 (MM) 细胞,诱导 caspase 依赖性凋亡 (apoptosis)。

SJ-MX6689 Pyroxamide Pyroxamide 是一种有效的组蛋白脱乙酰基酶 1 (HDAC1) 抑制剂,ID50 为 100 nM。 Pyroxamide 可以诱导白血病细胞凋亡和细胞周期停滞。
SJ-MX0604 TMP195

TMP195 是选择性和细胞活性的 IIa 类 HDAC 抑制剂,HDAC4、HDAC5、HDAC7 和 HDAC9 的 IC50 值分别为 111、106、46 和 9 nM;与其他HDAC (IC50 大于 10 μM) 相比,选择性提高至少 100 倍。TMP195 中的三氟甲氧基二唑 (TFMO) 是一个新的金属结合基团,它回避了其他金属酶抑制剂中所用的羟基酸盐基团的选择性和药理作用。

SJ-MX6746 HDAC-IN-7 HDAC-IN-7 (Chidamide impurity) 是 Chidamide 的一种杂质。Chidamide 是一种有效的,可口服的 HDAC 第 I 类 HDAC1/2/3 和第 IIb 类 HDAC10 抑制剂。
SJ-MX7889 MPT0E028 MPT0E028 是一种口服有效的,选择性 HDAC 抑制剂,对 HDAC1,HDAC2 和 HDAC6 的 IC50 分别为 53.0 nM,106.2 nM,29.5 nM。MPT0E028 通过诱导细胞凋亡降低 B 细胞淋巴瘤的活力,同时具有有效的直接 Akt 靶向能力,降低 B 细胞淋巴瘤中的 Akt 磷酸化。MPT0E028 具有良好的抗癌能力。